De nuevo el torneo se lleva a cabo en forma clandestina pero esta vez convocado por el grupo llamado NEST. Como no se sabe nada sobre el paraderos de Kyo y puesto que Goro no desea participar, Benimaru se ve en la necesidad de hacer equipo con 2 personas recomendadas por los organizadores K’ y Máxima. En este torneo hay una nueva regla que establece que debe haber 4 peleadores por equipo y terminan completando el cuarteto con Shingo. Por su lado los Ikari reciben a una chica llamada Sally a la cual rebautizan con el nombre clave de Whip. Ahora es el equipo de K’ el que llega a la final y tiene el derecho de enfrentarse al último oponente, Krizalid.
Al mismo tiempo Heidern comunica a las unidades de fuerzas especiales que ha detectado un grupo de clones de Kyo y al parecer están esperado la señal para iniciar una rebelión mundial, pero como la señal de ataque nunca llega los clones no ponen resistencia al momento de ser detenidos. Krizalid es vencido por K’ y en un acto de desesperación se implanta toda la información de los peleadores recabada a través del torneo, pero a pesar de esto vuelve a ser derrotado. En ese momento se escucha una voz que le dice a Krizalid que ya no lo necesitan porque lo que buscaban saber ya lo han conseguido, ahora saben que pueden insertar tanta información como deseen en un cuerpo.
La estructura de desploman y mandan tropas a destruir a K’ y Máxima pero logran escapar. En la confusión los Ikari también escapan, pero Whip se queda
al lado de Krizalid quien la confunde con su hermana, ella le explica que sus recuerdos al igual que los de ella son falsos. Krizalid finalmente muere y Whip se disculpa y se marcha dejando su cadáver para que las tropas de Heidern lo recojan. Mientras tanto en otro sitio Kyo despierta debido a las explosiones y a la voz de alguien que lo llama. Esa voz pertenece a Yagami que ha ido a buscarlo para matarlo, Kyo se marcha jurando vengarse por lo que le han hecho mientras Yagami solo destruye clones de Kyo pues no logra encontrar al verdadero. NEST declara que han logrado conseguir lo que deseaba y ordenan buscar a K’ y Máxima pues posen información valiosa, así inicia un nuevo